Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
EFNA3P52797 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA3P52797 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms