Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN3P51790 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms