Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms