Protein–RNA interactions for Protein: P47178

DAN1, Cell wall protein DAN1, yeastyeast

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DAN1P47178 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 REE1YJL217W 597 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 RPL17AYKL180W 555 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YKR047WYKR047W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 PEX12YMR026C 1200 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 POF1YCL047C 777 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 RRP5YMR229C 5190 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 SIR1YKR101W 1965 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 GSC2YGR032W 5688 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 ENA2YDR039C 3276 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 ENA1YDR040C 3276 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YOL075CYOL075C 3885 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 MUP3YHL036W 1641 nt2.9□□□□□ -1.95
DAN1P47178 MNR2YKL064W 2910 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 PDR12YPL058C 4536 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YDR271CYDR271C 372 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 RPL30YGL030W 318 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 OCT1YKL134C 2319 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 RPS28BYLR264W 204 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YBL065WYBL065W 345 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 MDM38YOL027C 1722 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 SET6YPL165C 1122 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 MAL12YGR292W 1755 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 MAL32YBR299W 1755 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 RSF2YJR127C 4143 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 ERG9YHR190W 1335 nt2.89□□□□□ -1.95
DAN1P47178 GGA1YDR358W 1674 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 SSU1YPL092W 1377 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 CWH43YCR017C 2862 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 RXT3YDL076C 885 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 DET1YDR051C 1005 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YER085CYER085C 522 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 ERG26YGL001C 1050 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YIL086CYIL086C 309 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YJL220WYJL220W 453 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 MSA2YKR077W 1092 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 snR34snR34 203 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 STU2YLR045C 2667 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 GAS5YOL030W 1455 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 FOX2YKR009C 2703 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 PWP2YCR057C 2772 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 SPO71YDR104C 3738 nt2.88□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YEH2YLR020C 1617 nt2.87□□□□□ -1.95
DAN1P47178 RPA14YDR156W 414 nt2.87□□□□□ -1.95
DAN1P47178 EDC1YGL222C 528 nt2.87□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YIM2YMR151W 438 nt2.87□□□□□ -1.95
DAN1P47178 CNA1YLR433C 1662 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 ARG5,6YER069W 2592 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 ARP4YJL081C 1470 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 RMD1YDL001W 1293 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 COS7YDL248W 1152 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 DOS2YDR068W 933 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 MIC26YGR235C 702 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 COS5YJR161C 1152 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 PHD1YKL043W 1101 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 CCS1YMR038C 750 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 TIR2YOR010C 756 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YPL162CYPL162C 822 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 FES1YBR101C 873 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 ULP1YPL020C 1866 nt2.86□□□□□ -1.95
DAN1P47178 SEC6YIL068C 2418 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 TCP1YDR212W 1680 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 TCM62YBR044C 1719 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 MDL1YLR188W 2088 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 ARD1YHR013C 717 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 BCD1YHR040W 1101 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 BET1YIL004C 429 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YLR326WYLR326W 723 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 TPP1YMR156C 717 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YPL114WYPL114W 420 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 SUI3YPL237W 858 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YBR137WYBR137W 540 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YER137C-AYER137C-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YER159C-AYER159C-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YJR026WYJR026W 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YJR028WYJR028W 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YAR010CYAR010C 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YML040WYML040W 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YML045W-AYML045W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YMR051CYMR051C 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
DAN1P47178 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.5 ms