Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RECQLP46063 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RECQLP46063 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RECQLP46063 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RECQLP46063 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RECQLP46063 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RECQLP46063 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms