Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA4P43694 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA4P43694 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA4P43694 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATA4P43694 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATA4P43694 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATA4P43694 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATA4P43694 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATA4P43694 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATA4P43694 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms