Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPD2P43304 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPD2P43304 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPD2P43304 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPD2P43304 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPD2P43304 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPD2P43304 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPD2P43304 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPD2P43304 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPD2P43304 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPD2P43304 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPD2P43304 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPD2P43304 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPD2P43304 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPD2P43304 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPD2P43304 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPD2P43304 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GPD2P43304 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPD2P43304 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPD2P43304 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPD2P43304 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPD2P43304 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPD2P43304 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms