Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LifrP42703 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LifrP42703 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LifrP42703 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LifrP42703 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LifrP42703 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LifrP42703 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LifrP42703 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LifrP42703 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LifrP42703 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LifrP42703 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LifrP42703 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LifrP42703 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LifrP42703 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LifrP42703 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LifrP42703 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms