Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ACP1YKL192C 378 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 SRN2YLR119W 642 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 GCD7YLR291C 1146 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 PPA2YMR267W 933 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MED7YOL135C 669 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 FDH1YOR388C 1131 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 ARO7YPR060C 771 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 ALA1YOR335C 2877 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 REB1YBR049C 2433 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 RXT3YDL076C 885 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 RPS18AYDR450W 441 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YFL065CYFL065C 309 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 HIS5YIL116W 1158 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 ANB1YJR047C 474 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YAL065CYAL065C 387 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 EMG1YLR186W 759 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 PRX1YBL064C 786 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YNL057WYNL057W 333 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YNR071CYNR071C 1029 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 LDS2YOL047C 1071 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 OSW1YOR255W 837 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 POC4YPL144W 447 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MDM38YOL027C 1722 nt3.5□□□□□ -1.85
DDI1P40087 BUD6YLR319C 2367 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 TRS120YDR407C 3870 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 APL4YPR029C 2499 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YHI9YHR029C 885 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 BAT2YJR148W 1131 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 SPC3YLR066W 555 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 PFA4YOL003C 1137 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 RPL18AYOL120C 561 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 CNS1YBR155W 1158 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 USA1YML029W 2517 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MNR2YKL064W 2910 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MTR4YJL050W 3222 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MIF2YKL089W 1650 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 PRR2YDL214C 2100 nt3.49□□□□□ -1.85
DDI1P40087 BYE1YKL005C 1785 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 CUS1YMR240C 1311 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 AIM14YGL160W 1713 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YCL068CYCL068C 783 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 CLC1YGR167W 702 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YBL010CYBL010C 843 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MPD1YOR288C 957 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MPC54YOR177C 1395 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 ERG5YMR015C 1617 nt3.48□□□□□ -1.85
DDI1P40087 ARO80YDR421W 2853 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 CIT1YNR001C 1440 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 RMD1YDL001W 1293 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 BUD30YDL151C 582 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MMS21YEL019C 804 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YIL086CYIL086C 309 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 ARG80YMR042W 534 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YNL181WYNL181W 1224 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YBL077WYBL077W 432 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YPL168WYPL168W 1293 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YPR059CYPR059C 387 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 NTA1YJR062C 1374 nt3.47□□□□□ -1.85
DDI1P40087 PEP7YDR323C 1548 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 ASI1YMR119W 1875 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 RTN1YDR233C 888 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 MIG3YER028C 1185 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 FMC1YIL098C 468 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YKL071WYKL071W 771 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YAR023CYAR023C 540 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 CDC73YLR418C 1182 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 RAD14YMR201C 1116 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 EOS1YNL080C 1101 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 PSF3YOL146W 585 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YOR131CYOR131C 657 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 AIM41YOR215C 558 nt3.46□□□□□ -1.86
DDI1P40087 PEX1YKL197C 3132 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 TRX3YCR083W 384 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 PDX1YGR193C 1233 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YJR037WYJR037W 384 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YKL177WYKL177W 339 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 DSE3YOR264W 1293 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 FRT2YAL028W 1587 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 BUD27YFL023W 2391 nt3.45□□□□□ -1.86
DDI1P40087 RPN6YDL097C 1305 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 PSY4YBL046W 1326 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 NOG1YPL093W 1944 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 FLO9YAL063C 3969 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 CWH43YCR017C 2862 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 VPS27YNR006W 1869 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 ERG26YGL001C 1050 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 MFA2YNL145W 117 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 snR17asnR17a 333 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 RPO21YDL140C 5202 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 TGL1YKL140W 1647 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 SRO9YCL037C 1305 nt3.44□□□□□ -1.86
DDI1P40087 BAR1YIL015W 1764 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YHL012WYHL012W 1482 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 KRE28YDR532C 1158 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YGR126WYGR126W 693 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 MIC26YGR235C 702 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 COS8YHL048W 1146 nt3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms