Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms