Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM23P36406 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms