Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms