Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA3P32297 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms