Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR1P32246 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR1P32246 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR1P32246 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR1P32246 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR1P32246 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR1P32246 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR1P32246 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR1P32246 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR1P32246 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR1P32246 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms