Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA13P31271 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms