Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC27P30260 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC27P30260 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC27P30260 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC27P30260 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC27P30260 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC27P30260 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC27P30260 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms