Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms