Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjc1P28229 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms