Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms