Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCP20941 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCP20941 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCP20941 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCP20941 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCP20941 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCP20941 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCP20941 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCP20941 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCP20941 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCP20941 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCP20941 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCP20941 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCP20941 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCP20941 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCP20941 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCP20941 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCP20941 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCP20941 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCP20941 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCP20941 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCP20941 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCP20941 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCP20941 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCP20941 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCP20941 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCP20941 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCP20941 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCP20941 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms