Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASTP20810 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASTP20810 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASTP20810 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASTP20810 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASTP20810 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASTP20810 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASTP20810 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CASTP20810 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASTP20810 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASTP20810 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASTP20810 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASTP20810 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASTP20810 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASTP20810 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASTP20810 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASTP20810 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASTP20810 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASTP20810 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms