Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM1P18669 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms