Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms