Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD2P13995 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD2P13995 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD2P13995 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD2P13995 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD2P13995 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD2P13995 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD2P13995 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD2P13995 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD2P13995 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD2P13995 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD2P13995 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD2P13995 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD2P13995 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD2P13995 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD2P13995 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD2P13995 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD2P13995 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD2P13995 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD2P13995 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD2P13995 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD2P13995 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD2P13995 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD2P13995 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms