Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms