Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms