Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC166P0CW27 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms