Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRBP09619 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRBP09619 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRBP09619 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRBP09619 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRBP09619 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRBP09619 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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