Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNAP02545 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNAP02545 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNAP02545 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNAP02545 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNAP02545 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNAP02545 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNAP02545 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNAP02545 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNAP02545 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNAP02545 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNAP02545 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNAP02545 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNAP02545 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNAP02545 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNAP02545 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNAP02545 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNAP02545 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNAP02545 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNAP02545 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNAP02545 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNAP02545 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNAP02545 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms