Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01667 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01667 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01667 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01667 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01667 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01667 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01667 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01667 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01667 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01667 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01667 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01667 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms