Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP1P01033 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms