Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR1AO95602 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLR1AO95602 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms