Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN7O95471 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN7O95471 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms