Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM13AO94988 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM13AO94988 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM13AO94988 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM13AO94988 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM13AO94988 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM13AO94988 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM13AO94988 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM13AO94988 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms