Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A2O94788 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms