Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms