Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPS6KA4O75676 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms