Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms