Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KIAA0556O60303 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms