Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ2O43526 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNQ2O43526 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms