Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC11O43248 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC11O43248 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms