Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A4O43246 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms