Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN4O15554 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms