Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms