Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO1FO00160 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYO1FO00160 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms