Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms