Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNRNPCL3B7ZW38 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms