Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DGG1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DGG1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DGG1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DGG1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DGG1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DGG1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DGG1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DGG1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DGG1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DGG1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DGG1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DGG1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DGG1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DGG1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DGG1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DGG1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DGG1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
B4DGG1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
B4DGG1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms