Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3BL1B0FP48 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3BL1B0FP48 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3BL1B0FP48 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3BL1B0FP48 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3BL1B0FP48 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3BL1B0FP48 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3BL1B0FP48 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3BL1B0FP48 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BL1B0FP48 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL1B0FP48 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms