Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPDC1A2A3K4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms